| allele |
相關(guān)的個體或菌株含有相同基因的穩(wěn)定的其它形式，該形式區(qū)別于這一位置的現(xiàn)有的序列(和或許其它序列) |
| attenuator |
存在調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的終止的DNA區(qū)域，它控制了一些細(xì)菌操縱子的表達(dá)；位于啟動子和第一個結(jié)構(gòu)基因之間，引起轉(zhuǎn)錄的部分終止的序列區(qū)段 |
| C_region |
免疫球蛋白輕和重鏈的恒定區(qū)，和T-細(xì)胞受體α，β，和γ鏈；根據(jù)特定的鏈可包括一個或多個外顯子 |
| CAAT_signal |
CAAT盒；位于可能參與RNA聚合酶結(jié)合的真核生物轉(zhuǎn)錄單位的起始點的75bp上游的保守序列的一部分；共有序列=GG(C或T)CAATCT |
| CDS |
編碼序列；對應(yīng)于蛋白質(zhì)中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括終止密碼子)；特征包括氨基酸概念上的翻譯 |
| conflict |
在這一位點或區(qū)域，單獨確定的“相同”序列有所不同 |
| D-loop |
置換環(huán)；線粒體DNA內(nèi)的一個區(qū)域，其中RNA的短的序列與DNA的一條鏈配對，代替了這一區(qū)域的原始配對DNA鏈；也用于說明在RecA蛋白質(zhì)催化的反應(yīng)中，侵入的單鏈替代雙鏈DNA的一條鏈的區(qū)域 |
| D-segment |
免疫球蛋白重鏈的多變區(qū)，和T-細(xì)胞受體的β鏈 |
| enhancer |
順式-作用序列，它增強了(一些)真核生物啟動子的作用，并能在任一方向和與啟動子相關(guān)的任何位置處(上游或下游)起作用 |
| exon |
編碼剪接mRNA部分的基因組區(qū)域；可以含有5'UTR，所有CDS，和3'UTR |
| GC_signal |
GC盒；位于真核生物轉(zhuǎn)錄單位起始點上游的保守的富含GC區(qū)域，可以以多重拷貝 或任一方向存在；共有序列=GGGCGG |
| gene |
鑒定為基因的生物學(xué)意義的區(qū)域，并已經(jīng)指定名稱 |
| iDNA |
間插DNA；通過幾種重組中的任何一種能被消除的DNA |
| intron |
被轉(zhuǎn)錄的DNA區(qū)段，但通過同時剪接位于其兩側(cè)的序列(外顯子)即可從轉(zhuǎn)錄本內(nèi)部將其除去 |
| J_segment |
免疫球蛋白輕鏈和重鏈的連接區(qū)段，和T-細(xì)胞受體α，β和γ鏈 |
| LTR |
長的末端重復(fù)，在確定序列的兩端直接重復(fù)的序列，類型典型地見于逆轉(zhuǎn)錄病毒中 |
| mat_peptide |
成熟的肽或蛋白質(zhì)的編碼序列；翻譯后修飾之后成熟的或最終的肽或蛋白質(zhì)產(chǎn)物的編碼序列；位置不包括終止密碼子(與相應(yīng)的CDS不同) |
| misc_binding |
不能用任何其它Binding關(guān)鍵詞(primer_bind或protein_bind)表述的與另一個組成成分共價或非-共價結(jié)合的核酸中的位點 |
| misc_difference |
特征序列與記載中存在的有所不同，并且不能用任何其它不同關(guān)鍵詞(conflict，unsure，old_sequence，mutation，variation，allele或modified_base)表述 |
| misc_feature |
不能用任何其它的特征關(guān)鍵詞表述的具有生物學(xué)意義的區(qū)域；新的或少見的特征 |
| misc_recomb |
任何一般性的，位點特異性的或復(fù)制的重組事件的位點，該位點中有不能用其它重組關(guān)鍵詞(iDNA和virion)或來源關(guān)鍵詞的修飾詞(/insertion_seq，/transposon，/proviral)表述的雙螺旋DNA的斷裂和愈合 |
| misc_RNA |
不能用其他RNA關(guān)鍵詞(prim_transcript，precursor_RNA，mRNA，5'clip，3'clip，5'UTR，3'UTR，exon，CDS，sig_peptide，transit_peptide，mat_peptide，intron，polyA_site，rRNA，tRNA，scRNA和snRNA)限定的任何轉(zhuǎn)錄本或RNA產(chǎn)物 |
| misc_signal |
含有控制或改變基因功能或表達(dá)之信號的任何區(qū)域，所述信號不能用其他Signal關(guān)鍵詞(promoter，CAAT_signal，TATA_signal，-35_signal，-10_signal，GC_signal，RBS，polyA_signal，enhancer，attenuator，terminator，和rep_origin)表述 |
| misc_structure |
不能用其他Structure關(guān)鍵詞(stem_loop和D-loop)表述的任何二級或三級結(jié)構(gòu)或構(gòu)象 |
| modified_base |
被指示的核苷酸是經(jīng)修飾的核苷酸，并應(yīng)由被指示的分子(在mod_base修飾詞意義中給出)所取代 |
| mRNA |
信使RNA；包括5'非翻譯區(qū)(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)和3'非翻譯區(qū)(3'UTR) |
| mutation |
在此位置處，相關(guān)品系的序列中具有突發(fā)的，可遺傳的變化 |
| N_region |
在重排的免疫球蛋白區(qū)段之間插入的額外的核苷酸 |
| old_sequence |
在此位置處，所表述的序列修改了此序列以前的版本 |
| polyA_signal |
聚腺苷酸化之后內(nèi)切核酸酶裂解RNA轉(zhuǎn)錄本所必需的識別區(qū)域；共有序列=AATAAA |
| polyA_site |
RNA轉(zhuǎn)錄本上的位點，通過轉(zhuǎn)錄后聚腺苷酸化該位點將被加上腺嘌呤殘基 |
| precursor_RNA |
仍不是成熟的RNA產(chǎn)物的任何RNA種類；可包括5'剪切區(qū)(5'clip)，5'非翻譯區(qū)(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)，間插序列(內(nèi)含子)，3'非翻譯區(qū)(3'UTR)，和3'剪切區(qū)(3'clip) |
| prim_transcript |
初級(最初的，未加工的)轉(zhuǎn)錄本；包括5'剪切區(qū)(5'clip)，5'非翻譯區(qū)(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)，間插序列(內(nèi)含子)，3'非翻譯區(qū)(3'UTR)和3'剪切區(qū)(3'clip) |
| primer_bind |
起始復(fù)制，轉(zhuǎn)錄或逆轉(zhuǎn)錄的非－共價的引物結(jié)合位點；包括合成的例如PCR引物元件的位點 |
| promoter |
參與RNA聚合酶的結(jié)合以啟動轉(zhuǎn)錄的DNA分子區(qū)域 |
| protein_bind |
核酸上非－共價的蛋白質(zhì)結(jié)合位點 |
| RBS |
核糖體結(jié)合位點 |
| repeat_region |
含有重復(fù)單位的基因組區(qū)域 |
| repeat_unit |
單個重復(fù)元件 |
| rep_origin |
復(fù)制起點；復(fù)制核酸以得到兩個相同拷貝的起始位點 |
| rRNA |
成熟的核糖體RNA；將氨基酸裝配成蛋白質(zhì)的核糖核蛋白顆粒(核糖體)中的RNA成份 |
| S_region |
免疫球蛋白重鏈的開關(guān)區(qū)；它參與重鏈DNA的重排，導(dǎo)致來自相同B－細(xì)胞的不同免疫球蛋白類的表達(dá) |
| satellite |
短的基本重復(fù)單位的很多串聯(lián)重復(fù)(相同或相關(guān)的)；大多數(shù)具有的堿基組成或其它性質(zhì)與基因組的一般水平不同，這使得它們與大部分(主帶)的基因組DNA分離開來 |
| scRNA |
小的細(xì)胞質(zhì)RNA；幾個小的細(xì)胞質(zhì)RNA分子中的任何一個存在于真核生物的細(xì)胞質(zhì)和(有時)核中 |
| sig_peptide |
信號肽編碼序列；被分泌的蛋白質(zhì)的N－末端結(jié)構(gòu)域的編碼序列；此結(jié)構(gòu)域涉及新生多肽與膜的結(jié)合；前導(dǎo)序列 |
| snRNA |
小的核RNA；很多小的RNA種類中的任何一個都被局限于核中；幾個snRNA參與剪接或其它RNA加工反應(yīng) |
| source |
鑒定序列中特定范圍的生物來源；此關(guān)鍵詞是強制性的；每一項至少要有一個跨越整個序列的單一來源關(guān)鍵詞；每個序列可允許有一個以上的來源關(guān)鍵詞 |
| stem_loop |
發(fā)卡結(jié)構(gòu)；由RNA或DNA單鏈的相鄰(反向)互補序列之間的堿基一配對形成的雙螺旋區(qū)域 |
| STS |
序列標(biāo)記位點：表述基因組上作圖界標(biāo)并能通過PCR檢測的短的，單拷貝DNA序列；通過測定STS系列的次序即可作出圖譜的基因組區(qū)域 |
| TATA_signal |
TATA盒；Goldberg-Hogness盒；在每個真核生物RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄單位起點前約25bp處發(fā)現(xiàn)的保守的富含AT的七聚體，它可能涉及使酶定位以正確地起始；共有序列=TATA(A或T)A(A或T) |
| terminator |
或者位于轉(zhuǎn)錄本的末端或者與啟動子區(qū)域相鄰的DNA序列，該序列可導(dǎo)致RNA聚合酶終止轉(zhuǎn)錄；也可以是阻抑蛋白的結(jié)合位點 |
| transit_peptide |
轉(zhuǎn)運肽編碼序列；核編碼的細(xì)胞器蛋白質(zhì)N-末端結(jié)構(gòu)域的編碼序列；此結(jié)構(gòu)域參與將蛋白質(zhì)翻譯后運送到細(xì)胞器中 |
| tRNA |
成熟的轉(zhuǎn)移RNA，小的RNA分子(75－85個堿基長)，介導(dǎo)核酸序列翻譯成氨基酸序列 |
| unsure |
作者不能確定此區(qū)域的準(zhǔn)確序列 |
| V_region |
免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區(qū)，和T－細(xì)胞受體α，β和γ鏈；編碼可變的氨基末端部分；可由V_segment，D_segment，N_region和J_segment組成 |
| V_segment |
免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區(qū)段，和T-細(xì)胞受體α，β和γ鏈；編碼大多數(shù)可變區(qū)(v_region)和前導(dǎo)肽的最后幾個氨基酸 |
| variation |
含有來自相同基因的穩(wěn)定突變的相關(guān)系列(例如RFLP，多態(tài)性等)，在此(和可能其它)位置處所述相同基因與被表述的不同 |
| 3’clip |
在加工過程中被切下的前體轉(zhuǎn)錄本3'端大部分區(qū)域 |
| 3’UTR |
不被翻譯成蛋白質(zhì)的成熟轉(zhuǎn)錄本的3'末端區(qū)域(終止密碼子之后) |
| 5’clip |
在加工過程中被切下的前體轉(zhuǎn)錄本5'端大部分區(qū)域 |
| 5’UTR |
不被翻譯成蛋白質(zhì)的成熟轉(zhuǎn)錄本的5'末端區(qū)域(起始密碼子之前) |
| -10_signal |
Pribnow盒；細(xì)菌轉(zhuǎn)錄單位起點上游約10bp處的保守區(qū)域，它可能參與結(jié)合RNA聚合酶；共有序列=TatAaT |
| -35_signal |
細(xì)菌轉(zhuǎn)錄單位起點上游約35bp處的保守六聚體；共有序列=TTGACa[]或TGTTGACA[] |
